根據《企業所得稅會計準則》第三百四十四號準則，企業在供應商開具的電子普通發票免稅的農產品中，抵扣進項稅額時，應選擇農產品收購發票抵扣，而不是農產品銷售發票抵扣。 具體而言，農產品收購發票是指企業用于所收農產品購買的國家規定發票樣式，這種發票屬于包含直接購買稅收和進項稅收的價格，而農產品銷售發票則只包含直接購買稅收，無進項稅收內容，故農產品收購發票是抵扣進項稅額的有效發票。 由此可見，在供應商開具的電子普通發票中，如果需要抵扣進項稅額，則必須使用農產品收購發票。不過，在計算免稅額時，應在農產品收購發票中減去進項稅收部分，以計算真實免稅額度。 拓展知識： 農產品收購發票和農產品銷售發票的區別在于：農產品收購發票包含直接購買稅收和進項稅收，而農產品銷售發票則只包含直接購買稅收，無進項稅收內容。因此，抵扣進項稅額時，必須使用農產品收購發票，而不是農產品銷售發票。