是的，稅務機關會查詢企業是否為員工繳納社會保險。如果企業沒有繳納社會保險，并且還申報下撥個稅，那么這一行為將會被稅務機關查處，企業將面臨追繳財產的風險。 雖然企業沒有繳納社會保險，但是企業仍然需要關注員工的社會保險繳納情況，實行個人社會保險制度。在這種情況下，企業可以采取下列措施： 一是對工資實施有規律的發放，不要出現特別大的金額； 二是建立嚴格的工資發放制度，并實行過程檢查程序； 三是明確社保責任主體，并及時繳納個人的社保費用； 四是定期向稅務機構報告員工的社保信息，如社保繳納情況、個人所得稅等。 通過以上措施，企業可以有效避免稅務機關的處罰，同時也可以保證員工的社會保障權益。 拓展知識：社會保險是指社會為保障公民包括職工、無業人員、農民等在生育、婚嫁、工傷、醫療、失業、護理、退休等方面提供保障的一種制度。該制度定期向社會繳納保險費，當參保人員遇到意外情況時，保險機構會根據申請者的具體情況進行理賠，以保障申請者的正常生活。