是的，自然人股東轉讓股份應當申報印花稅。根據《中華人民共和國印花稅法》第三十三條規定，轉讓股份的收購者應當在獲得股份后15日內，在受轉讓地納稅機關處繳納印花稅，否則應當按照當地稅務機關的規定，按照雙倍標準繳納補繳印花稅。同時，受讓方也應該報送相關財務資料給稅務機關，用于計算印花稅的應納金額。 拓展知識：印花稅是國家對股權交易行為實施征收的一種稅收，其應納金額依據交易金額和發行價格而定。另外，任何跨境股權交易都需要繳納印花稅，否則可能被視為逃稅行為，受到重罰。