根據相關法律法規規定，專項附加扣除原則上是要在個人所得稅申報表填報，要求納稅人填寫完稅務機關提供的申報表后，將其蓋章并附上相關證明材料，遞交到稅務機關備案的。如果納稅人在個稅系統中輸入了資料，稅務機關也會根據納稅人提供的資料開展審核，但個人仍然要辦理蓋章及附證材料等專項扣除申報手續。拓展知識：在提交專項附加扣除申報材料時，納稅人應攜帶本人身份證、戶口簿、社保卡等身份證明材料，準確填寫稅務機關提供的申報表，并附上相關申報資料，專項附加扣除申報資料要求完整、細致、準確。