完稅證明查詢下載與補打有著一定的區別，首先，查詢下載是指把稅務機關原來網上發布的完稅憑證信息及其附件查詢下載的操作；而補打是指對已發出的憑證，因數據缺失或其他原因需要更改或補充內容后，經稅務機關處理后，再次簽發的行為。另外，查詢下載主要是供稅務機關、繳款人、代征、代理等機構及個人了解稅務憑證有關情況，補打則是替代原稅務憑證的具有法律效果的文件。拓展知識：完稅證明的電子版在法律上也是有效的，與紙質版的效力是一致的。