小微企業在100萬到三百萬之間的企業所得稅繳納的比例是5%。首先，該企業在小規模納稅人范圍內，應繳納個人所得稅，即“小微企業所得稅增值稅綜合改革試點項目”，以及它們從事生產經營活動得到的增值稅。小微企業在100萬到三百萬之間，繳納的企業所得稅稅率為5%。因此，小微企業在100萬到三百萬之間繳納的企業所得稅比例是5%。 在進行企業所得稅繳納時，企業應當按照國家規定的稅率進行繳納，在計算應繳納稅款時，還需要減去一定的稅費減免數額。比如，小微企業可以減免稅收應稅費用，比如原材料、原料加工費、是和低值易耗品等，經國家明確批準的其他應稅費用也可以減免稅款。另外，小微企業還可以享受一些國家稅收優惠政策，比如減稅或抵免稅等。 綜上所述，小微企業在100萬到三百萬之間按5%的比例繳納企業所得稅，在計算應繳稅款時要減去相應的稅費減免額，并享受政府的稅收優惠政策來降低企業的稅收支出。