公司工會委員會適用的會計制度，主要取決于工會的性質、范圍和規模。如果是一個大型工會，則應當適用小企業會計準則;如果是一個中小型工會，則應當適用民間非盈利組織會計制度。小企業會計準則依據《中華人民共和國企業會計準則》，規定了小企業收入核算、成本核算、財務報告披露等重要財務會計準則，以幫助小企業更好地開展財務記賬工作。民間非盈利組織會計制度依據《中華人民共和國民間非盈利組織會計制度》，主要規定了非盈利組織收入、支出、資產負債等重要財務會計準則，旨在幫助非盈利組織做好財務會計管理及相關報表披露等工作。此外，還可以根據實際情況制定其他會計制度，以便更好地管理會計。比如，根據資金的使用目的，可以設立特定的經費賬戶，以跟蹤經費的流動情況，從而更好地監督和管理會計系統。