公司替員工支付提升學歷的費用應該通過籌款賬戶進行入賬處理。首先，應將所有費用進行總體匯總，按照統一的賬戶進行入賬，例如支出明細、收款賬戶等，并記錄此筆費用的明細，如學費、交通費、住宿費用等，以便日后進行核對和對賬。同時，匯總費用記錄應當按照原始憑證的內容存放，防止憑證之間的缺失和報錯。此外，財務支付入賬也應考慮員工實際發生的費用，例如收取學費是否存在欠條或者延期付款，是否有折扣優惠等。 拓展知識：根據國家有關財務規定，公司替員工支付學費，若超過5000元的，應當將員工的報銷金額、報銷日期、本人身份證號等信息提供給財務，并由財務按照現行規定進行稅和報銷的支出處理，以確保雙方的稅收繳納和報銷到位。