總公司和分公司報稅一般是分開報稅的。在稅務機關實施增值稅分期繳納和非居民稅收適用優惠辦法時，不再劃分總公司和分公司，而是統一報稅。 工商年檢一般是各個分公司各自進行的，每個分公司需要自身報備資料進行工商年檢，總公司只負責協調把控。 拓展知識：在企業分支機構管理工作中，總公司除了負責協調把控外，還要定期收集統計和監督檢查分支機構的財務報表，及時發現各分支機構的不規范操作，掌握各分支機構的財務狀況，從而加強財務管理。