是的，苗木普票可以抵扣。抵扣的條件是：1、抵扣的苗木普票可以用于納稅人的全部營收事項，但不可在增值稅發票中開具抵扣；2、抵扣金額必須在營收事項中明確計入；3、在一張營收事項中可抵扣的苗木普票有限，不能超出已完稅金額；4、所抵扣的苗木普票必須在營收事項中明細列示；5、在同一事項中，每張苗木普票最多可以抵扣三份營收事項。