應當做賬務處理，并對期初和期末調整。在已經正常做賬但未取得發票的情況下，應當按實際情況計提應稅費用，然后后期又取得了發票，可以按發票金額調整匯算清繳并調減應稅費用，還有一些拓展處理，比如可能存在挪用憑證的情況，那么就要對期初累計未確認損益項目進行調整等，以確保稅務稽查的合法性，確保正確的匯算清繳。