申請增值稅專用電子發票流程如下： 1.企業或個人需要先向所在地的稅務部門申請開通增值稅專用發票電子注冊，需提供相關資料，完成審核。 2.在稅務部門審核完成后，將獲取專用發票的購方的納稅號、發票代碼以及發票號碼。 3.購方企業填寫開票資料并申請領用增值稅專用發票。 4.申請開票的企業可登錄稅務部門的網站，申請開具增值稅專用發票，在線提交開票申請，并可以查看發票開具狀態，申請審核通過后下載發票，將發票信息打印出來使用。 通過增值稅專用發票電子化交易，一定程度上提高了稅收管理的便捷性和效率性，納稅人也可方便快捷的進行發票開具和查詢，提高了發票使用的便捷性。