年度匯算清繳的調增或調減根據全年實際繳納的各種稅款進行計算，比如一個企業2015年全年應交稅款為10000元，由于增值稅稅率變更，2016年至2018年每年全年應交稅款為15000元，那么2015年實際繳納的稅款就比2016年-2018年低，所以在2018年年度匯算清繳時，將按照10000×3=30000減掉，將15000×3-30000=0作為最終應繳，因此年度匯算清繳也可能調增稅款，而不一定只有調減稅款。