是的，公司可以對部分愿意購買公積金的員工單獨開設賬戶。公司可以支付部分購買金，而員工也可以自己支付部分購買金，至少是每個人購買金額的一半。公積金的賬戶可以多個部門共用，但是每個部門的員工可以有不同的賬戶，從而確保所有的員工的資金安全。此外，如果單獨的賬戶實施管理，可以有效降低支付和使用的成本。