首先，應該要求員工提供個稅App里作出專項附加的收據，并核實是否正確。其次，如果收據是正確的，應該要求員工在系統中進行相應的記錄，以記錄納稅人作出專項附加扣除。最后，要及時更新企業的系統，以確保能夠更準確地反映員工的個人所得稅繳納情況。 拓展知識：專項附加扣除是一項由國家規定的扣除項目，采取專項附加扣除可以有效減少企業和個人的稅負，從而改善經濟環境。