分公司員工的社保是由總公司代繳的，每個月分公司將代繳納的錢轉給總公司，對于分公司來說，從賬務上分公司應該區分出自己繳納員工社保所需要的費用，并建立賬戶記錄。在報稅時，分公司需要把份公司繳納的社保費記錄在個人社保部分里，以便于稅務機關核算查詢。 如果分公司社保費用過大，分公司可以考慮與總公司簽訂勞動合同，這樣可以有效減少分公司的社保費用。此外，分公司還可以根據地方政府政策，簽訂一定的人力資源服務協議，將員工社保費用由分公司承擔轉移到總公司承擔，以此降低財務負擔。