可以，但是需要經過一定的流程和手續：首先，總公司應根據子公司的申請將資金轉入子公司的財務賬戶中；其次，總公司應根據子公司開具的發票編制和審核資金支付憑證，并出具正式發票給子公司；最后，在你付款完成之前，子公司需要向稅務部門申報及繳納相關稅款。拓展知識：發票開給子公司就是按照委托代理發票開出，即由總公司經營過程中產生的收入自行結算發票，發票由總公司開出，但稅款由子公司自行繳納。