企業庫存商品發生毀損、短缺損失，可以向稅務機關申報扣除資產損失，僅需填報企業所得稅年度納稅申報表《資產損失稅前扣除及納稅調整明細表》，不再報送資產損失相關資料。相關資料由企業留存備查。 處理依據： 1、國家稅務總局關于企業所得稅資產損失資料留存備查有關事項的公告（國家稅務總局公告2018年第15號 ） 2、國家稅務總局關于發布《企業資產損失所得稅稅前扣除管理辦法》的公告（國家稅務總局公告2011年第25號） 第二十六條存貨盤虧損失，為其盤虧金額扣除責任人賠償后的余額，應依據以下證據材料確認： （一）存貨計稅成本確定依據； （二）企業內部有關責任認定、責任人賠償說明和內部核批文件； （三）存貨盤點表； （四）存貨保管人對于盤虧的情況說明。 第二十七條存貨報廢、毀損或變質損失，為其計稅成本扣除殘值及責任人賠償后的余額，應依據以下證據材料確認： （一）存貨計稅成本的確定依據； （二）企業內部關于存貨報廢、毀損、變質、殘值情況說明及核銷資料； （三）涉及責任人賠償的，應當有賠償情況說明； （四）該項損失數額較大的（指占企業該類資產計稅成本10%以上，或減少當年應納稅所得、增加虧損10%以上，下同），留存備查自行出具的有法定代表人、主要負責人和財務負責人簽章證實有關損失的書面申明。（國家稅務總局公告2018年第65號取消存備查專業技術鑒定意見（報告）或法定資質中介機構出具的專項報告） 第二十八條存貨被盜損失，為其計稅成本扣除保險理賠以及責任人賠償后的余額，應依據以下證據材料確認： （一）存貨計稅成本的確定依據； （二）向公安機關的報案記錄； （三）涉及責任人和保險公司賠償的，應有賠償情況說明等。