委托書自己保存備查嗎？賬需要分兩個賬戶做賬，還是都做到總公司

好，這個需要做賬務處理，三方蓋章簽字，三方都需要有。

是分成總公司一個帳套，分公司一個帳套做賬嗎？

啊，你們增值稅是不是獨立的，如果是的話就需要。

獨立的，現在分公司貨款從總公司走賬，購買的商品的成本發票也開在一起，后面這種是不是需要分開開發票

需要分開的，總公司購入的開給總公司，分公司購入的開給分公司。