是的，電子稅務局可以更新商品代碼庫。但是在這之前，您需要確認您填寫的商品代碼是否正確。您可以根據相關稅務條例和發布的報關單，確認商品的準確的編碼。然后，根據電子稅務局的技術指南，您可以更新商品代碼庫。