第二套房的契稅計算公式是應納稅額=計稅依據×稅率。 根據《中華人民共和國契稅法》第三條：契稅稅率為3%到5%。具體適用稅率由省、自治區、直轄市人民政府在稅率范圍內決定。 面積小于或等于90平方，契稅稅率為1% 。 面積大于90平方，契稅稅率為2% 。 部分地區為3%。