高新企業(yè)和軟件企業(yè)在做賬和稅務方面存在一些區(qū)別。一般來說，高新企業(yè)的研發(fā)費用較高，需要設置專門的研發(fā)費用科目進行核算，同時享受研發(fā)費用加計扣除的稅收優(yōu)惠政策。而軟件企業(yè)需要根據(jù)軟件企業(yè)的稅收政策進行稅務處理，同時軟件企業(yè)的增值稅稅負較高，需要注意合理規(guī)劃進項稅抵扣和銷項稅的核算。