財稅〔2009〕9號文件中關于依照6%征收率的規定調整為“依照3%征收率”。這意味著自來水公司作為增值稅一般納稅人銷售自產自來水，可以按照3%的征收率繳納增值稅，不得抵扣進項稅額。 2002年國家稅務總局發布《關于自來水行業增值稅問題的通知》（國稅發〔2002〕56號），進一步明確自來水公司銷售自來水按6%的征收率征收增值稅的同時，對其購進獨立核算水廠的自來水取得的增值稅專用發票上注明的增值稅稅款（按6%征收率開具）予以抵扣。