當義務人同意履行債務時，確實會喪失以訴訟時效屆滿為由的抗辯權，因為同意履行意味著義務人承認債務的存在并愿意履行，從而在法律上放棄了時效抗辯。但是，這里的關鍵是“同意履行”這個行為本身也可以被視為訴訟時效中斷的法定事由之一。 訴訟時效中斷的目的是為了保護權利人的利益，防止因義務人在訴訟時效期間的某些行為導致權利人錯過訴訟時機。因此，當義務人同意履行時，法律認為權利人有理由相信債務將會被履行，從而不必急于起訴。這種情況下，如果訴訟時效期間繼續計算，可能會導致權利人在義務人最終不履行時無法通過訴訟保護自己的權利。