是的，稅務局的系統通常是設計成只能對全部符合條件的進項稅進行勾選認證，而不能單獨勾選本期應認證的部分。這樣做是為了簡化認證流程和提高效率。如果有特殊情況需要處理，可以嘗試聯系當地稅務局咨詢具體操作。