但是現在甲方并沒有讓開票，也暫時沒有打算，因為資金問題，還不準備回款，只是審計報告出了，也需要交嗎？有沒有明文規定呢？

一般的時候是收到預收款，開票之前預交。

我們的項目是營改增之前完工了，但款項沒有給完我們，票也暫時不讓我們開，但單位要求我們去預繳稅款，這樣合理嗎？

預繳審計金額剩余未給款項的稅款

不跨地區收到預收款繳納增值稅，跨地區的沒有詳細規定