稅務局說要按全額繳納呀，我不理解

你在申報系統就能看見可以差額扣除的

申報企業所得稅時候沒有差額扣除呀

找到法律依據了，是全額征收 《國家稅務總局關于跨地區經營建筑企業所得稅征收管理問題的通知》(國稅函〔2010〕156號)第三條規定：“建筑企業總機構直接管理的跨地區設立的項目部，應按項目實際經營收入的0.2%按月或按季由總機構向項目所在地預分企業所得稅”。其中“實際經營收入”為收入概念，非所得概念，不扣除分包和其他扣除支付給其他單位的款項。

增值稅可以扣除分包金額預繳，企業所得稅和印花稅是按合同金額全額預繳是吧

是的，就是那個意思的