親愛的學員，您好！很高興能為您提供幫助，您的問題答復如下：
問題1：因為是聯營企業的話，甲公司對乙公司有重大影響，且持有的是重大經濟利益，因此會因自身利益對獨立性產生嚴重不利影響。

問題2：如果持有100股股票，不重大，這種情況下，雖然審計項目團隊成員的妻子與乙公司之間存在經濟利益關系，但由于持股比例不重大，這種關系可能不會被認為會對審計師的獨立性產生嚴重的不利影響。然而，具體情況還需要根據其他因素（如乙公司在甲公司業務中的重要性等）來綜合判斷。
祝您學習愉快！