親愛的學員，您好！很高興能為您提供幫助，您的問題答復如下：

-B.由當事人協商確定案件的管轄法院：是協議管轄的內容，協議管轄，是指當事人在爭議發生之前或發生之后，用書面協議的方式，選擇管轄法院。這里考察的是選擇管轄的規定。
-C.由有管轄權的法院商確定案件的管轄法院：這種情況不符合《民事訴訟法》的規定，法院之間不會通過商議來確定管轄權。
-D.由共同上一級法院指定其中一個法院受理案件：這種情況通常適用于管轄權爭議的情況，而不是在多個法院均有管轄權時的選擇問題。

因此，選項B、C、D都不符合《民事訴訟法》的規定，只有A是正確的。
祝您學習愉快！