親愛的學員，您好！很高興能為您提供幫助，您的問題答復如下：
有風險。作為一般納稅人，在進行二手車交易時，應當取得合法有效的增值稅扣稅憑證，以確保可以抵扣進項稅額。如果只收取到二手車交易發票而沒有收到增值稅發票，可能會影響您公司的稅務處理，導致無法正常抵扣相關稅費，建議與銷售方溝通解決此問題。
祝您學習愉快！