親愛的學員，您好！很高興能為您提供幫助，您的問題答復如下：

1.取得土地使用權支付的價款為3000萬元，題目沒說契稅稅率，暫不考慮。

2.房地產開發成本=3000/（1+13%）+1000/（1+9%）=3572.30萬元

3.房地產開發費用=（3000+3572.30）*10%=657.23萬元

4.轉讓該項目的增值稅=（15000-3000）/（1+9%）*9%=990.83萬元。

允許扣除的稅金=990.83*（7%+3%）=99.08萬元

5.附加扣除金額=（3000+3572.30）*20%=1314.46萬元

扣除項目金額合計=3000+3572.30+657.23+99.08+1314.46=8643.07萬元

不含增值稅收入=15000-990.83=14009.17萬元

增值額=14009.17-8643.07=5366.1

增值率=5366.1/8643.07*100%=62.09%

適用稅率40%，速算扣除系數5%。

應納土地增值稅=5366.1*40%-8643.07*5%=1714.29萬元。

祝您學習愉快！