親愛的學員，您好！很高興能為您提供幫助，您的問題答復如下：
是的，商業健康保險、稅收遞延型商業養老保險、個人養老金支出這三項扣除限額都可以納入綜合所得計算中。在具體處理時，這些項目會作為依法確定的其他扣除項從應納稅所得額中減除。例如：
假設某納稅人2025年的綜合所得收入為12萬元，已知“三險一金”等專項扣除為1.8萬元，子女教育等專項附加扣除為1.2萬元，符合條件的公益慈善事業捐贈為3000元。此外，該納稅人在這一年中還購買了商業健康保險支出2400元（年度限額），稅收遞延型商業養老保險支出6000元，個人養老金支出5000元。計算應退或應補稅額時，這些扣除項將從綜合所得收入中減除：\[\text{應納稅所得額}=120,000-60,000-18,000-12,000-3,000-2,400-6,000-5,000\]\[\text{應納稅所得額}=120,000-106,400=13,600\]然后根據適用稅率和速算扣除數計算最終的稅額。
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