殘疾人保障金計算的上年在職職工工資總額是應發工資，不包括報酬以外的一些費用，比如專項獎金、津貼、補貼等。 根據《財政部國家稅務總局中國殘疾人聯合會關于印發<殘疾人就業保障金征收使用管理辦法>的通知》（財稅〔2015〕72 號）第八條規定，保障金按上年用人單位安排殘疾人就業未達到規定比例的差額人數和本單位在職職工年平均工資之積計算繳納。計算公式如下：保障金年繳納額=（上年用人單位在職職工人數×所在地省、自治區、直轄市人民政府規定的安排殘疾人就業比例-上年用人單位實際安排的殘疾人就業人數）×上年用人單位在職職工年平均工資。