分公司員工的社保在分公司所在地繳納，工資可以通過總公司發放。法律依據為《中華人民共和國公司法》第十四條：公司可以設立分公司。設立分公司，應當向公司登記機關申請登記，領取營業執照。分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。 只要用人單位按時發放工資和繳納社保，是不違反法律的。