水資源稅改革試點實施辦法處理稅收征收的特殊情況主要包括以下幾個方面：
1. 對于水資源稅征收對象的特殊情況，實施辦法可能會規定哪些單位或個人需要繳納水資源稅，以及如何確定稅收的征收標準。
2. 在征收水資源稅時，可能會考慮到一些特殊情況，例如對于水資源的不同利用方式可能會有不同的稅率，或者對于某些特定行業或地區可能會有稅收減免或減免的政策。
3. 水資源稅的征收方式也可能會根據特殊情況進行調整，例如對于特定行業或地區可以采取分階段逐步實施稅收的方式，以減輕稅收對企業或個人的沖擊。

總的來說，水資源稅改革試點實施辦法會根據實際情況和特殊情況進行靈活處理，以確保稅收的征收合理有效，并促進水資源的合理利用和保護。