行政機關會計核算是以收付實現制為基礎。其財務管理的基本原則是：執行國家有關法律、法規和財務規章制度；厲行節約，禁止奢侈浪費；量入為出，保證重點，兼顧一般；注重資金使用效益。因此，審計機關根據組織部門委托事項，對行政機關領導干部任期經濟責任審計的主要內容應體現在以下幾個方面：

　　（1）內部控制制度審計的內容。

　　對行政單位黨政領導干部進行經濟責任審計，首先應當對黨政領導所在單位、部門的內部控制制度制訂和執行情況進行審計，這樣才有利于進一步考察和評價被審計領導干部的管理思路、領導能力、領導方法和管理水平。因為作為一個單位或部門的主要領導是否善于利用內部控制這一現代管理工具進行高效而規范的管理，不僅僅是管理能力的體現，而且是管理理念和管理風格的反映。雖然行政單位內部控制的內容和企、事業單位不完全相同，但其控制目的和管理者目標是一致的。行政單位同樣要采取各種有效控制方式，以實現單位有效管理，保證對內對外提供的各種管理信息真實可靠，保證各項法令得到貫徹執行。

　　行政單位內部控制制度審計的內容，主要是審查有無建立和貫徹必要的內部控制程序，是否有效地運用各種控制方法和手段；其次是審查有無建立和執行必要的會計控制制度和管理控制制度。

　　（2）任期內單位財務收支情況審計。

　　主要圍繞任期內單位預算的編制和執行，以財政收支、財務收支的真實性、合法性和效益性作為審計的主線條，突出領導干部任期內對單位預算管理、財務收支管理、資產管理、應繳款項和暫存款項管理等經濟活動應負有的直接責任和主管責任。

　　①任期內預算編報情況的審查。

　　行政機關預算是根據單位職責和工作任務進行編制的年度財務收支計劃。國家對行政機關的人員、房屋、車輛等編制及各項支出的標準均有明確規定。單位預算實行預算管理級次報領和核撥經費。對任期內預算編報情況審計，主要審查預算編報是否及時，真實、準確，有無虛列預算項目，騙取國家撥款的情況，有無突破國家規定的開支范圍和開支標準，編制赤字預算等問題。

　　②任期內預算執行情況的審查。

　　行政機關必須按照批準的預算組織實施，并定期將單位預算執行情況向同級財政或上級主管部門報告。對任期內預算執行情況審計，主要審查任期內預算執行情況是否真實、合法、有效；檢查預算批復和撥款的到位、管理情況；審查撥入的行政經費、事業經費、專項經費使用是否符合批準預算范圍，各項開支是否合規合法，有無虛列預算支出，轉移預算資金，編制虛假預算執行的情況。

　　③任期內單位各項收入和支出管理情況的審查。

　　行政機關收入是指單位依法取得的非償還性資金，包括財政預算撥款收入、預算外資金收入及其他合法收入。支出是指行政機關為開展業務活動所發生的資金耗費，包括經常性支出、專項支出和自籌基本建設支出。行政機關的各項收入和支出必須全部納入單位財務預算統一管理和核算，進行統籌安排使用。單位組織的各項收入應首先用于彌補經常性支出不足和必要的專項支出。對任期內單位各項收入和支出的審計，應從銀行賬戶入手，審查任期內單位各部門的各項收支是否納入單位財務部門集中管理，統一核算，審查有無違反規定提高開支標準、擴大開支范圍，亂發獎金、津貼、補助和實物及揮浪費等問題。是否存在多頭開戶，管理分散，各項收入不入賬，轉移和隱瞞收入，設置賬外賬和“小金庫”等問題。

　　④任期內專項資金管理和使用情況的審查。

　　主要審查任期內預算安排的各種專項經費是否做到專款專用，有無截留、擠占挪用專項經費問題。查明代政府管理的預算外資金的籌集分配與使用情況以及使用的效果。

　　查明救災、水利、扶貧、住房公積金等專項基金的籌集、分配與使用情況及其使用效果。

　　查明有無建立健全保險基金管理制度，是否實行“收支兩條線”并做到專戶存儲；查明保險基金征收是否遵循了國家規定的范圍、標準和比例，有無任意擴大征收范圍或提高征收比例，有無欠收及任意減免現象；是否按照國家規定的項目、標準和比例及時足額發放養老保險和待業人員生活費等，有無任意拖欠或壓低發放標準問題，有無任意擴大或縮小發放范圍問題；查明是否按規定的比例提取管理費、生產自救費、轉業訓練費、再就業工程補助費等，有無預提或超比例提取問題，其使用是否合法、合理；轉業訓練費、生產自救費、再就業工程補助費所產生的收益是否全部計入就業保險基金；保險基金專戶存款利息是否轉作基金，有無轉入小金庫或貪污、私分或亂開支問題；向上級政府交納的調劑基金是否按規定上繳，有無漏繳、少繳問題；有無動用保險基金放貸投資造成損失，有無擠占挪用基金征地、購房、購車等，有無巧立名目提取費用，化基金為經費以彌補經費不足或濫發亂用等。

　　⑤任期內預算外資金收入情況的審查。

　　預算外資金收入是指財政部門按規定從財政專戶核撥給行政機關的預算外資金和部分經財政部門核準不上繳預算外資金財政專戶，而直接由行政機關按計劃使用的預算外資金。對任期內預算外資金審查，主要審查任期內單位按國家規定組織的預算外資金收入是否符合規定和及時上繳財政專戶，有無不按規定納入財政專戶管理，隱瞞、轉移預算外資金收入問題，支出是否合規合法。

　　⑥任期內財務管理和內部監督控制制度建立健全情況的審查。

　　主要審查任期內單位財務管理是否嚴格執行國家現行財政法規和財經紀律，單位內部監督控制制度是否建立、健全和有效，有無貪污、私分、侵占、挪用公款及公共財務等違法違紀問題。

　　⑦任期內單位設備購置情況的審查。

　　主要審查任期內屬于政府采購范圍的資產、設備是否納入政府采購中心統一采購問題。

　　⑧任期內行政事業性收費情況的審查。

　　主要審查單位履行或代行政府職能收取的各項行政事業性收費是否納入預算管理；未納入預算管理的行政事業性收費是否納入財政專戶存儲，執行“收支兩條線”規定；審查任期內有無未經批準擅自增加收費項目、擴大收費范圍、提高收費標準等亂收費、亂集資、亂攤派問題。

　　⑨任期內罰沒收入情況的審查。

　　查明罰沒收入是否符合國家有關財經法規和處罰條例，有無濫罰亂收及以罰代處問題；對罰沒款物管理是否嚴格遵守收支兩條線的管理規定，罰沒收入是否及時足額地上繳財政，有無自行提成、坐支、截留等問題，有無罰款不開票，罰款開少、收入不少的問題，有無私吞私分問題；查明罰沒收入的收繳有無合法的手續和嚴格的管理制度，如是否開具財政部門印制的專用罰沒票據，有無用白條收款，有無建立罰沒收入專用賬戶，有無將罰沒收入混入其他經費收入賬戶，造成罰沒收入被擠占，是否嚴格地實行了收繳分離制度；查明罰沒物資是否有詳細登記，有無專人保管，有無私分、丟失、損壞等現象，處理拍賣是否由財政部門、公證部門與主管部門共同處理，有無故意壓價私分現象。

　　⑩任期內財政預算使用效果情況的審查。

　　主要審查任期內財政預算資金的使用是否取得了較好的效益和效果。行政機關經費的使用效益主要體現為社會效益，一是經費的使用是否達到預期的目的，即行政機關是否履行了其法定職責，向社會提供了有效的服務；二是經費的使用是否做到合理節約，有無明顯不當和損失浪費的情況。

　　（3）任期內資產審計。

　　行政機關資產包括流動資產和固定資產。對任期內的資產審計，主要審計核實任職初期、任期內和離任時所在部門、單位會計核算的各項資產是真實、安全和完整。查清任職初期、任期內和離任時各項資產的增減變化及保值增值情況。

　　①審查任期內流動資產情況。

　　行政機關流動資產是指可以在一年內變現或耗用的資產，包括現金、銀行存款、暫付款、庫存材料等。對任期內流動資產審計，主要審查現金和銀行存款安全、完整情況；審查暫付款是否及時進行清理，有無長期拖欠情況；審查庫存材料管理制度是否建立健全，領用手續是否齊備。

　　②審查任期內固定資產情況。

　　主要審查任期內資產管理制度是否建立健全；資產增減變動手續是否齊備；對各項資產是否定期進行清理、盤點；有償轉讓、變賣固定資產所得的收入和清理報廢處理的固定資產變價收入是否作為單位收入入賬；已報廢處理的固定資產是否及時核銷；有無收入不入賬和已核銷的固定資產仍長期掛賬，造成單位資產不實問題；在固定資產的購置、使用和管理方面，是否嚴格按規定辦理，有無重采購，輕管理，使用效率低，造成損失浪費及以權謀私等問題。

　　③審查任期內有無將國有資產化為集體或個人所有情況。

　　主要審查國有非經營性資產轉為經營性資產是否按規定辦理有關手續，出租的國有資產是否按規定繳納有關稅費。

　　④審查任期內對外投資情況。

　　主要審查任期內對外投資是否真實存在，有無收益及損失問題。

　　（4）任期內負債審計。

　　行政機關負債包括應繳預算款、應繳財政專戶款、暫存款等。對任期內負債審計，主要審計核實任期內和離任時所在部門、單位債務是否真實、合法、有效；查清各項債務形成原因、用途及增減變化情況，測試其償債能力；同時，對將屬于收入款項、行政和事業等經費結余作為債務長期掛賬，致使其任期內負債不真實的應進行揭示；此外，審計中還應對利用負債類科目進行出租、出借單位銀行賬戶的問題進行查處。

　　①審查任期內各種應繳預算款情況。

　　應繳預算款是指行政機關在業務活動中按國家規定取得的應繳財政的各種款項。對任期內各種應繳預算款審計，主要審查任期內各種應繳財政款項是否及時、足額上繳財政，有無隱瞞、坐支、截留、挪用問題。

　　②審查任期內暫存款情況。

　　暫存款是指行政機關在業務活動中與其他單位和個人發生的待結算款項。對任期內暫存款審計，主要審查暫存款是否及時清理并按規定辦理，有無將收入款項、行政和事業等經費結余作為債務長期掛賬，致使任期內收入、負債、凈資產不真實的問題。

　　（5）任期內凈資產審計。

　　凈資產是指行政機關資產減負債和收入減支出的差額，包括固定基金、結余等。對任期內凈資產審計，主要審計核實領導干部離任時所在部門、單位凈資產是否真實、合法、有效。審計的重點應放在任期內經費結余的真實、合法和有效方面。

　　（6）任期內重大經濟決策審計。

　　主要審查任期內重大經濟活動（包括投資、引進等項目）、開支決策是否經過集體討論，可行性分析及專家論證，有無未經集體討論，擅自決定造成重大損失浪費、國有資產嚴重流失等重大經濟損失問題，分清被審計領導干部應負的直接責任和主管責任。

　　（7）任期內經濟責任目標完成情況審計。

　　經濟責任目標是政府與其職能部門簽訂的，考核行政機關領導干部任期經濟責任的工作目標責任書。行政機關領導干部任期各年度經濟責任目標的完成與否，是政府和組織部門對行政機關領導干部任期經濟責任進行考核和獎懲的重要依據。通過對任期內經濟責任目標、單位工作目標及計劃完成情況的審計，客觀公正地評價其任期內工作業績的好與差。

　　（8）任期內領導干部個人廉潔自律及遵守國家財經法紀情況審計。

　　對任期內領導干部個人廉潔自律及遵守國家財經法紀情況審計，是領導干部任期經濟責任審計的重要組成部分，通過對領導干部本人任期內遵守國家廉政紀律和國家財經法紀情況審計，評價領導干部本人任期內是否嚴格執行國家的各種廉潔自律規定和國家財經法紀規定。

　　（9）其他需要審計的事項。

　　審計中如果發現與領導干部任期內應負有直接責任和主管責任的重大事項，但沒有納入已制定的審計工作方案范圍，審計組可根據情況調整審計工作方案，報經審計機關批準，延伸審計有關單位和有關事項。