主營業務成本可以設置為二級科目。在會計科目設置中，主營業務成本是一項重要的成本科目，通常包括原材料、直接人工、制造費用等，對于企業的成本核算和管理具有重要的作用。為了更好地管理和控制成本，可以將主營業務成本設置為二級科目，以便更加細致地管理和分析各項成本。同時，二級科目的設置也有利于財務報表的編制和分析，能夠更加準確地反映企業的經營狀況和財務狀況。