在發票勾選平臺中，道路通行費發票能否勾選抵扣，取決于發票類型。如果是左上角標識 “通行費” 字樣，且稅率欄次顯示適用稅率或征收率的通行費增值稅電子普通發票，可以通過發票勾選平臺進行勾選抵扣。而左上角無 “通行費” 字樣，稅率欄顯示 “不征稅” 的通行費電子發票，以及紙質的高速公路通行費發票和一級、二級公路通行費發票，均不能勾選抵扣。紙質的橋、閘通行費發票，也不能勾選抵扣，但其可以通過計算來抵扣進項稅額，計算公式為：橋、閘通行費可抵扣進項稅額 = 橋、閘通行費發票上注明的金額 ÷(1+5%)×5%。