國庫集中支付制度是國庫集中收付制度的組成部分。 其次，國庫集中支付制度是相對于現行的財政國庫資金分散支付而言的。現行的財政資金撥付，是由單位按照預算級次層層上報用款計劃，再由財政按下達的預算，將資金從國庫撥付到一級單位，一級單位按照預算級次層層下撥到基層單位，基層單位再根據有關規定及業務需要，購買商品或支付勞務款項，形成財政資金實際支出。國庫集中支付方式就是改變現行的財政資金層層撥付程序，由國庫集中支付機構在指定銀行開設國庫集中支付專戶，將資金直接從集中支付專戶支付給收款人。 再次，國庫集中支付制度是以計算機技術的發展和廣泛應用為基礎的，是歷史發展和社會進步的必然產物。實行國庫集中支付制度的主要控制目標和依據是財政預算指標，沒有功能強大、快速的財政預算管理和信息反饋系統是無法實現的。另外，還要求有一個準確、及時的銀行結算系統作保障。隨著計算機技術的發展和應用的普及，2012年已完全能夠滿足這一改革的需要。 綜上所述，國庫集中支付制度是國庫集中收付制度的重要組成部分，它是改變現行的財政資金層層撥付程序，以計算機網絡技術為依托，以提高財政資金使用效益為目的，由國庫集中支付機構在指定銀行開設國庫集中支付專戶，將所有財政資金存入國庫集中支付專戶，單位在需要購買商品或支付勞務款項時提出申請，經國庫集中支付機構審核后，將資金直接從集中支付專戶支付給收款人的國庫資金管理制度。 改革現行機構設置和管理體制 實行國庫集中支付制度，首先要改革財政部門現行的機構設置和現行的財政核算體系，建立國庫支付中心、會計核算中心、政府采購部門有機結合的支付體系，確立預算審核、資金支付、監督管理為一體的預算機構設置和管理體制。 改進資金管理方式 根據國庫集中支付制度的基本內容和國外經驗,應當建立單一賬戶和分類賬戶相結合的賬戶體系,實現集中資金、集中核算、集中支付。現階段我國應在堅持資金使用權和審批權不變的前提下，取消各預算單位原來的一切賬戶，由國庫集中支付中心在人民銀行開設“國庫單一賬戶”，將所有政府財政資金都存放于該賬戶，并在預算單位需要實際支付時，將資金從國庫單一賬戶直接撥付供應商。在此之前，資金應該始終存放于國庫單一賬戶中。與此對應的是建立國庫分類賬冊管理體系，即在國庫單一賬戶下為每個預算單位都設立支出總賬和分類賬，記錄它們各自的預算執行情況和資金使用情況。政府的財政預算部門每年給預算單位下達預算指標，并審批預算單位提出的用款申請，委托支付中心辦理具體的支付手續。 按照這種資金管理方式，政府財政資金支付都在國庫單一賬戶體系下統一進行，財政預算部門還要在商業銀行開設零余額賬戶，并為預算單位開設零余額賬戶，通過零余額賬戶，對政府財政資金采取財政直接支付和財政授權支付兩種方式支付到商品和勞務供應商。財政直接支付制度是按照部門預算和用款計劃確定的資金用途和用款進度，根據用款單位申請，由財政部門將資金直接支付到商品、勞務供應者或用款單位。財政授權支付是根據部門預算和用款計劃確定的資金用途和用款進度，由預算單位自行開出支付令將資金支付到商品、勞務供應者或用款單位。商業銀行代理支付的財政資金，每日與財政部門開設在中國人民銀行的國庫單一賬戶進行清算。 規范資金運行程序 資金管理方式的變革要求資金支付程序也隨之進行改革。按照政府財政資金的用途和性質，可將支出分為大宗購買支出、工資性支出和其他支出三大類，分別采用不同的方式進行支付。