匯算清繳操作流程大致可分為以下幾個步驟： （一）申報準備階段 1.獲取申報所需的資料。企業應準備本次申報期間的財務報表，財務會計憑證、賬簿，稅務報表等。 2.收集本次申報期間的事項記錄和重要日期記錄。如重要客戶生效日期、重要交易日期等。 （二）申報準備就緒階段 1.分析本次匯算清繳期間，影響納稅義務發生的因素，綜合分析，對本次匯算清繳納稅義務進行說明，并出具相關報告。 2.準備本次申報所需的文件。企業需備齊匯算清繳申報表、納稅檢查表、完稅憑證、發票原件或復印件及其他有關納稅義務憑證。 （三）申報正式開始階段 1.準備申報系統工具。確定申報系統，如中央稅務局申報系統、地稅申報系統等，做好申報系統準備。 2.進行系統操作，填寫匯算清繳申報表，計算本次納稅義務。 3.調整稅收優惠政策，核定抵扣額度，審核企業申請書，確定本次申報的應納稅額。 （四）申報結果驗證階段 1.對本次匯算清繳申報表，以及本次匯算清繳納稅義務各項抵扣、減免等情況進行核實，以確保此次匯算清繳申報沒有錯誤。 2.確定本次匯算清繳應繳納稅額，與實際應繳稅額進行核對，確保準確無誤。 （五）提交申報階段 1.進行發票對賬，確認納稅義務數額。 2.進行稅款繳納，按照規定的繳款期限及方式，繳納本次匯算清繳的應繳稅款。 3.向稅務機關提交本次匯算清繳申報表，以及納稅義務申報資料，提交本次匯算清繳申報完成。 （六）申報結束階段 1.等待稅務機關審核，接收并確認審核結果，如有疑問繼續進行溝通協調，直至本次匯算清繳申報結果確認。 2.關閉本次匯算清繳稅務申報事項，檢查整理完善本次匯算清繳記錄，以備將來查詢需要。