在準備注銷公司的過程中，針對有未勾選的進項稅，需要根據相關稅收法律來進行處理，一般情況下，企業應當盡快在有稅負的情況下，按照稅務局的規定，對自己完成注銷程序之前的稅款進行舍棄，然后在撤銷的時候可以向稅務局申請抵扣退稅。同時，注銷前也可以提交申請，把稅款抵扣提前完成，可以加快注銷流程。 除此之外，在公司注銷前，還需要提醒財務人員，要多注意稅務登記證等相關資料的確認和保管，確保資料的完整性和準確性，以便今后退稅等事宜做出必要的配合。此外，需要注意查驗和保存稅務機關出具的相關證件，以備萬一申請時出現不以的情況時作為查證憑證。