按照《中華人民共和國企業會計準則》第二十五號條文的規定，工會籌備金按實際發放的工資數額進行扣稅。因為申報的工資可能存在某些優惠政策，如個人所得稅減免政策，而實際發放的工資就不在此列，其中的稅費則由工會籌備金支付。如此規定可以確保政府和勞動者在各自領域受益，也符合當前國家財政政策和稅收法規政策要求。此外，根據國家規定，個人所得稅扣繳率最低不低于4.0％，最高不高于45％。根據實際工資情況，可以確定應繳稅款扣繳比例，以期落實財政征稅要求。拓展知識：由于工會籌備金的性質是“為增強工會能力，豐富工會活動內容”，所以只有在“實際發放的工資”的基礎上才能保證資金的有效使用，從而達到最大的價值。