農業種植合作社可以開勞務費的發票，但是受國家稅收政策的管控，其開具的發票的稅率需要根據具體情況而定，一般情況下，如果是企業從個體戶采購服務，則稅率為3%，而如果是企業與企業之間的交易，則稅率為6%。另外，關于開發票，還需要注意發票內容必須填寫完整準確，且有效期滿才能入賬。此外，農業種植合作社開發票還可以減少稅收，因為發票上明確的稅額可以對收入進行減免，減輕稅收負擔，但是要注意發票只能作為稅收減免申請依據，不能用作抵扣現金。