處理增值稅電子普通紅字發票的具體流程如下： 1、發票核銷：收到發票后，首先要進行核銷，將發票的基本信息與合同的基本內容進行核對； 2、發票沖銷：當發票的金額大于當期應付款時，可以進行沖銷，即發票的金額大于應付款，就可以用發票的剩余金額來沖抵下一期的付款； 3、稅務申報：發票核銷和沖銷完后，要將發票的信息提交給主管稅務機關進行申報，稅務機關根據發票信息對其進行審核，審核完成后才能認定其為抵扣稅額； 4、發票登記：將發票信息與稅務機關的審核結果登記到本企業的賬務記錄上，以便今后開展相關的稅務審計。 以上是增值稅電子普通紅字發票的處理過程，但并不是所有發票都可以歸類到此處。在實際操作中，要根據不同發票的不同特性再做出相應的調整，以更好地滿足企業的實際需求。