B公司可以通過銀行匯款或網上轉賬給A公司，也可以通過支票對A公司進行支付，但是A公司收款時無法開具發票。B公司可以通過與A公司簽訂服務協議，在協議中規定通過支付寶、微信支付或銀行匯款給A公司支付款項，收款后A公司提供詳細的發票并進行開票，B公司也可以在發票上面填上自己的公司名稱和稅號，以獲得對應的增值稅發票。 除了上述方式以外，A公司也可以將款項轉到一個第三方賬戶，該第三方賬戶賬號屬于私人賬戶，B公司可以先將費用支付到這個第三方的賬戶，然后A公司可以在第三方賬戶中提取這些款項，這種方式也可以獲得發票，但也存在一定風險，A公司要對此進行謹慎對待。