根據《個人所得稅法實施條例》的規定，公司在更正納稅申報后，多繳的稅款可以通過批量發放工資的形式發給員工。例如：某公司在更正申報時發現多繳稅款，其多繳的稅款可以匯入集團公司的賬戶，然后再分配給集團公司下屬各子公司，最后以發放工資的形式發放給每一位員工。