交通運輸企業會計核算方法包括：1、依據企業營運規模和特點，采用統一核算體系和標準財務會計制度；2、按照財務會計準則和國家會計準則，妥善處理會計分錄和會計帳目；3、要求按時編制會計報表，并報送會計機構；4、運用多種會計檢查技術，核實會計數據的準確性；5、應用計算機軟件和系統，實現自動核算和記賬；6、定期審計，保證會計數據的真實性和準確性。