公司申請破產后，債務的處理方式是由法院根據《中華人民共和國破產法》來審理的，按照破產法的規定，無論是公司債權人還是債務人，都需要按照“優先受償法”的原則，對每一個債務進行審理。例如，對國家義務的優先受償，再是勞動、社保等職工債權，第三是實現擔保物權等，最后是普通債權。根據審理結果，有可能是全部清償，也有可能是分期清償，甚至是全部放棄。