航空運輸電子客票行程單可以通過旅客自行申請抵扣。抵扣的具體流程是，旅客乘坐的航空公司提供的電子客票代碼，通過航空公司官網申請，或者撥打客服電話索取，即可在機場報檢時使用電子客票行程單進行抵扣。 例如，許小明乘坐“東風航空”航班到北京。他先在“東風航空”官網根據訂單號申請抵扣，將獲取到的電子客票代碼憑借到機場報檢口，即可完成抵扣。