一般來說，對于注冊為門市部、經營部、商行的個體工商戶的開票賬務處理，可以采取如下步驟：1.準備經營明細賬，包括收支明細賬、應收賬款明細賬、應付賬款明細賬、庫存量明細賬等；2.登記發票明細；3.計算應納稅額；4.準備銷售收入與支出報表；5.準備應交稅款報表；6.核算預繳稅款。此外，還需要登記增值稅特殊納稅人和定期扣繳稅款，并履行完稅義務。